Corso di Perfezionamento teorico-pratico
La rapida diffusione di piattaforme di sequenziamento dell’RNA a singola cellula (scRNA-seq) sta creando una crescente esigenza di formare persone in grado di analizzare i risultati ottenuti. L'analisi dei dati scRNA-seq richiede nuovi approcci analitici, non potendo basarsi sui principi validi per l’analisi di dati ottenuti con RNA-seq in bulk. In questo corso verranno illustrati campi di applicazione del scRNA-seq, e saranno discussi i metodi computazionali e statistici più appropriati attualmente disponibili per l’analisi di dati di scRNA-seq.
In particolare, il corso si propone di fornire ai partecipanti le competenze per:
- Comprendere i concetti di base dell'analisi dei dati scRNA-seq
- Utilizzare il flusso di lavoro Seurat per i dati scRNA-seq
- Processare e analizzare i dati scRNA-seq, inclusi la classificazione cellulare, l'identificazione di popolazioni cellulari specifiche, l'integrazione e la correzione dei batch
- Misurare la dinamica dell'espressione genica a livello di singola cellula
- Eseguire l'analisi di arricchimento dei geni, caratterizzare le interazioni cellula-cellula e analizzare le traiettorie cellulari
- Condurre l'analisi del TCR e l'integrazione multiome
- Riconoscere l'importanza dell'analisi dei dati scRNA-seq nel promuovere la scoperta e l'innovazione in medicina, biologia e biotecnologia
Modalità di svolgimento:
Lezioni frontali e seminari, dry lab (attività individuale in aula informatica sotto la guida di tutors).
Corso a numero chiuso limitato a 30 partecipanti.
Sede di svolgimento:
Università degli Studi di Milano
Via Santa Sofia, 9/1
20122 Milano
Riferimenti e contatti:
Prof. Domenico Mavilio – Prof.ssa Silvia Della Bella
citometria.biometra@unimi.it
www.linkedin.com/in/flowcytometryacademy-unimi
Lingua di svolgimento:
inglese
Domanda di ammissione:
Le informazioni sulla scadenza per la presentazione delle domande saranno disponibili a breve.
Quota di iscrizione:
616,00 € IVA inclusa
Su richiesta, Materia Prima è a disposizione per l’eventuale organizzazione e gestione dell’ospitalità (viaggio, soggiorno e transfer).
In caso di interesse, rivolgersi a segreteria@materia1a.it per ricevere eventuale quotazione.